東證二部指數是以在東京證交所第二部上市股票約550家公司為對象，並以市值為基準計算而成。指數以市值加權方式計算，同時考量股價和股數，因此，市值愈高的個股變動對指數變動的影響愈大，也較能反映市場上實際的狀況。

和東證一部指數不同的是，東證一部指數成員公司多為大型股，而東證二部指數則以小型、新進公司為主，因些東證二部指數常成為日本小型公司股票的評價總指標。